inputs: Zou je mij kunnen vertellen wat DNA-annotatie is?
targets: Ja, DNA-annotatie of genoomannotatie is het proces van het identificeren van de locaties van genen en alle coderende regio's in een genoom en het bepalen van wat die genen doen. Een annotatie (ongeacht de context) is een opmerking die wordt toegevoegd ter verklaring of commentaar. Zodra een genoom is gesequenced, moet het worden geannoteerd om er zin van te maken. Genen in een eukaryoot genoom kunnen worden geannoteerd met behulp van verschillende annotatietools zoals FINDER. Een moderne annotatie-pijplijn kan een gebruiksvriendelijke webinterface en software-containerisatie ondersteunen, zoals MOSGA. Moderne annotatie-pijplijnen voor prokaryotische genomen zijn Bakta, Prokka en PGAP. Voor DNA-annotatie wordt een voorheen onbekende sequentierepresentatie van genetisch materiaal verrijkt met informatie over genomische positie tot intron-exon grenzen, regulerende sequenties, herhalingen, genenamen en eiwitproducten. Deze annotatie wordt opgeslagen in genomische databases zoals Mouse Genome Informatics, FlyBase en WormBase. Educatief materiaal over sommige aspecten van biologische annotatie van de Gene Ontology-annotatiecampagne uit 2006 en soortgelijke evenementen is beschikbaar op de Gene Ontology-website. Het National Center for Biomedical Ontology ontwikkelt tools voor geautomatiseerde annotatie van databaserecords op basis van de tekstuele beschrijvingen van die records. Als algemene methode heeft dcGO een geautomatiseerde procedure voor het statistisch afleiden van associaties tussen ontologie-termen en eiwitdomeinen of combinaties van domeinen uit de bestaande gen-/eiwitniveau-annotaties.